Après des études doctorales en biochimie à l’Université de Montréal sous la direction de Luis A. Rokeach et Siegfried Hekimi, Jean-Claude Labbé effectue un premier stage postdoctoral au Département de biologie de l’Université de Caroline du Nord à Chapel Hill, aux États-Unis, sous la direction de Bob Goldstein, pour d’étudier la division asymétrique des cellules embryonnaires chez le nématode Caenorhabditis elegans. Il joint ensuite le laboratoire de Monica Gotta à l’Institut de biochimie de l’ETH Hönggerberg de Zurich, en Suisse, pour un deuxième stage postdoctoral portant sur la régulation de la polarité dans l’embryon de C. elegans.

Il est recruté par l’IRIC en 2005 pour y poursuivre ses travaux sur la régulation de la division cellulaire au cours du développement.