Sébastien Lemieux et son équipe mettent la bio-informatique au service du traitement et de l’analyse des données. Le groupe consacre principalement ses efforts au développement d’algorithmes en transcriptomique, protéomique et criblage haut débit.

Thématique de recherche

Les outils utilisés aujourd’hui en biologie moléculaire ont fait exploser le nombre d’observations qui peuvent désormais être réalisées en une seule expérience.

Le séquençage du génome humain, par exemple, qui nécessitait, il y a encore quelques années, des mois de travail, s’effectue aujourd’hui sur un seul appareil en quelques jours seulement.

Cette évolution technologique a généré un véritable tsunami de données quasi-impossible à analyser. Pour convertir les données brutes en connaissances, il faut s’appuyer sur des outils bio-informatiques. L’équipe de Sébastien Lemieux développe des outils d’analyse pour le développement d’algorithmes qui facilitent les analyses en séquençage d’ARN (RNA-Seq).

Objectifs de recherche 

L’Unité de recherche bio-informatique fonctionnelle et structurale répartit ses efforts entre deux missions. L’équipe de Sébastien Lemieux développe d’une part des techniques de prétraitement des données dans l’objectif d’augmenter leur précision.

Elle cherche à créer des outils capables de mieux extraire l’information significative, au niveau biologique, à partir de sources de données hétérogènes. Le groupe tente notamment de mesurer avec plus de précision les niveaux d’expression d’ARN messager, en plus d’être en mesure d’identifier les événements d’épissage ou la présence de mutations.

Les données brutes avec lesquelles les chercheurs travaillent sont souvent altérées par des biais expérimentaux issus de chacune des étapes menant à la production des données. En découvrant un à un ces biais, puis en mesurant l’impact de chacun sur les données, les chercheurs sont en mesure d’intégrer des correctifs à leurs algorithmes afin de minimiser leur impact.