La plateforme de Génomique offre une gamme de services qui combine conseils et accès à des technologies de pointe dans le domaine de la génomique. Les prestations offertes vont de la préparation des échantillons à la séquence de base, à la génération de très grands volumes de données de séquençage nouvelle génération (NSG).
La plateforme propose un service complet de PCR en temps réel et de Digital Droplet PCR (ddPCR), avec l’extraction de l’ARN aux résultats finaux et travaille en étroite collaboration avec la Plateforme de Bio-informatique de l’IRIC.
Services offerts :
- Séquençage par capillaire
- Séquençage d’ADN (plasmides, produits PCR, etc.)
- Résultats fournis en 48 h et accès personnalisé aux séquences sur un serveur sécurisé
- PCR en temps réel (qPCR) et Digital Droplet PCR (ddPCR)
- Séquençage de nouvelle génération
- RNASeq
- Amplicons
- Petits ARNs (miRNAs)
- Régions génomiques ciblées (séquençage d’exomes)
- ChIP-seq (immunoprécipitation et séquençage de la chromatine)
- Séquençage de l’ADN génomique (génome complet)
- Séquençage de cellule unique
- Accès à un service conseils sur la stratégie de séquençage optimale à adopter et le design expérimental
- Validation et analyse des résultats
- Analyse de l’ADN et de l’ARN
- Analyse de la qualité et quantité de l’ARN (rapport complet en format PDF, Indice de qualité RIN pour l’ARN)
Équipement
Séquençage Sanger
DNA analyzer ABI 3730
Séquençage de nouvelle génération
Illumina NextSeq500
Illumina MiSeq
10X Genomics Chromium Controller
qPCR
Life Technologies ViiA 7
Life Technologies QuantStudio 7 Flex
Roche LC480
Analyse de la qualité et quantité d’ARN
Agilent Bioanalyzer 2100
Spectrophotomètre
NanoDrop 8000
PCR digital
Biorad QX200
Sonicateur
Covaris S-series
Stations de pipettage semi-automatique
Biomek FX
EpiMotion