La plateforme de Bio-Physique/RMN fournit une solution d’avant-garde en spectrométrie par RMN avec un focus sur les expériences basées sur l’étude de la structure des protéines, des interactions protéine-ligand et des analyses de routine de petites molécules.
Services offerts :
- Analyse d’échantillons par RMN et analyse des spectres
- Accès aux scripts maison pour faciliter l’analyse des données de RMN
- Conseils et formation aux usagers pour :
- Incorporation d’isotopes stables et purification de protéines
- Élaboration de stratégies visant la détermination de structures de protéines et de petites molécules ainsi que l’étude de complexes protéine-ligand
- Traitement et interprétation des spectres RMN
- Utilisation de logiciels pour générer des structures 3D à partir de données provenant d’études de RMN
- Acquisition automatisée de spectres pour de petites molécules
- Spectres 1D de noyaux allant de 15N à 31P, comprenant 1H
- Spectres 2D, incluant COSY, NOESY, ROESY, HSQC, HMQC, HMBC, expériences H2BC
- Mise en œuvre d’expériences de RMN pour l’assignation et la détermination de structure de protéines, incluant notamment :
- Spectre pour la structure principale; HNCACB, HNCA, la LCSA (CO) NH, HNCOCA, HNCO, etc
- Spectre pour l’attribution des groupements; C (CO) NH-TOCSY, HC (CO) NH-TOCSY, HCCH-TOCSY, etc
- Spectre pour la production de contraintes structurelles; 2D, 3D, 4D 15N et 13C-édité NOESY, HNHA, HNHB
- Mise en œuvre de méthodes innovantes pour la réalisation d’expériences de RMN en accéléré y compris les acquisitions non-linéaires et les méthodes rapides SO-FAST
- Détermination de couplages dipolaires : IPAP-HSQC
- Accès au spectre pour étudier la liaison d’une petite molécule à des protéines; expériences MST 1D et 2D, expériences SDC 2D, expériences T1rho 1D, expériences de titration 2D 1H-15N HSQC. Expériences 3D avec sélection de filtres
Équipement
Bruker 600 MHz Avance III HD RMN équipé d’une sonde froide réglable 1H-19F QCIP 5mm ou sonde froide 1.7mm TCI avec chargeur d’échantillons refroidissant.
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- Études de biologie structurale, biologie chimique, petites molécules et criblage de fragments (collection de fragments de Maybridge and Key Organics)
400 MHz MR Varian automatisé
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- Pipeteur automatisé de 96 échantillons
- Deux canaux RF
- Sonde 5mm OneNMR avec sensibilité 1H and 13C accrue
- Détection des noyaux de 15N à 31P