La plateforme de Bio-informatique propose des services de développement algorithmique et d’analyses personnalisées de méga données, la gestion des bases de données et le développement de logiciels. Elle représente un atout important pour l’analyse des données générées par les différents groupes de recherche et sert de support technologique pour les autres plateformes de l’Institut.
Intimement liée à la plateforme de Génomique, elle inclut l’ensemble des travaux d’analyse de séquençage de nouvelle génération tels que l’assemblage sur génome de référence ou de novo de données de reséquençage, le transcriptome ou la capture d’exome, les analyses d’expression différentielles ou encore la détection de mutations.
La plateforme collabore aussi étroitement aux travaux réalisés en protéomique, chimie computationnelle, criblage à haut débit, et en biologie in vivo. Elle propose aussi des formations personnalisées sur différents thèmes reliés à la programmation et à l’analyse de données.
Services offerts :
- Analyses de données (massives ou non)
- Développement logiciel
- Design, implantation et maintien de bases de données et interfaces usagers
- Analyses statistiques
- Automatisation et parallélisation d’algorithmes
Équipement
50 serveurs de calcul
- 50 serveurs de calcul, dont la taille mémoire varie de 32GB à 512GB
(Total de 1300 cœurs de CPU et plus de 6TB de mémoire totale)
Unités de stockage reliées par réseau SAN
- Unités de stockage reliées par réseau SAN (capacité effective de 350TB)
- Des sous-réseaux Infiniband et 10Gbit servent à relier les serveurs afin d’optimiser les traitements nécessitant de grands transferts de données.