Résonance magnétique nucléaire et biophysique

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La plateforme résonance magnétique nucléaire et biophysique de l'IRIC est fonctionnelle depuis 2006. Elle exploite plusieurs techniques physiques dont le but est de caractériser les biomolécules. Elle offre principalement deux ressources : la résonance magnétique nucléaire (RMN) et la biophysique.

Située au Pavillon Marcelle-Coutu, cette plateforme sert les chercheurs de l'IRIC et de l'Université de Montréal. Elle est également accessible aux scientifiques externes en provenance du milieu universitaire et de l'industrie dans le cadre de collaborations et d'ententes de recherche.

Résonance magnétique nucléaire

Cette ressource offre une expertise de pointe en spectroscopie RMN et se consacre notamment aux expériences pour déterminer les structures en solution de protéines et d'autres biomolécules.

L'interprétation des résultats de RMN peut être longue et fastidieuse, particulièrement dans le cas de détermination de structures à une résolution atomique. En plus de veiller à l'entretien d'usage du spectromètre, nous offrons des services liés à l'acquisition et à l'analyse de données de RMN. Nous offrons également aux utilisateurs des conseils et de la formation dans les domaines suivants :

• Expression, marquage uniforme et purification de protéines
• Stratégies pour la détermination de structures
• Traitement et interprétation de spectres de RMN
• Exploitation de logiciels pour générer des structures 3D

• entretien de routine, y compris le dépannage et le remplissage en azote et Hélium
• acquisition des spectres de RMN pour l'attribution et la détermination structurelle des protéines. Ceux-ci comprennent (mais ne se limitent pas à) :
• Spectres pour l'attribution du squelette peptidique : HNCACB, HNCA, CBCA(CO)NH, HNCOCA, HNCO, HBHA(CBCACO)NH
• Attribution des chaînes latérales : C(CO)NH-TOCSY, HC(CO)NH-TOCSY, HCCH TOCSY
• Production des contraintes structurelles : NOESY 2D, 3D, 4D édités ¹⁵N et ¹³C/15N, HNHB, HNHA
• Détermination des couplages dipolaires résiduels en présence de milieux orientés : IPAP-HSQC
• conseil portant sur l'expression, le marquage uniforme et la purification de protéines
• conseil et aide pour le traitement et l'interprétation de spectres RMN
• accès et aide aux logiciels permettant l'analyse de spectres et la production de structures RMN. Ceux-ci comprennent : NMRPipe, NMRView, ARIA, XPLOR, CNS, CYANA, SPARKY
• accès à des scripts facilitant le transfert des données vers ou à partir d'un logiciel
• scripts pour NMRview visant à faciliter l'analyse
• aide pour l'utilisation des programmes de visualisation moléculaire et d'autres programmes d'analyse de structure tels que PYMOL, MOLMOL
• accès au cluster Linux constitué de 4 serveurs bi-processeurs et 6 postes de travail bi-processeurs (CPU opteron)

• spectromètre Varian Inova 600 MHz constitué de quatre canaux de radiofréquence capables d'exécuter des expériences à résonances multiples et multidimensionnel avancés (jusqu'à 4D)
• sonde de mesure triple résonance ( ¹H, ¹³C, ¹⁵N) de 5 mm spécifique pour les biomolécules, caractérisée par un gradient de champ pulsé à triple axe et une possibilité de découplage des ²H
• sonde à bande large de 5mm avec un gradient de champ pulsé à axe simple
• HCN chiliprobe
• Cluster Linux constitué de 4 serveurs bi-processeurs et 6 postes de travail bi-processeurs (CPU opteron). Variété de logiciels comprenant XPLOR, ARIA, CYANA et CNS (tous capables de fonctionner avec processeurs multiples), et d'autres logiciels de visualisation (NMRView, NMRPipe, NMRDraw, pymol, molmol)

Ressource de biophysique

Ce service fournit aux utilisateurs l'accès et la formation à l'appareil de dichroïsme circulaire (CD), au fluorimètre et à la centrifugeuse ultra-analytique.

Appareillage

• Ultracentrifugeuse analytique Beckman Coulter XL-I
• Spectropolarimètre CD Jasco 810
• Fluorimètre Jasco FP-6500

Tarification

 Consultez notre grille de tarifs.

Personnes ressources

Pour obtenir plus de renseignements au sujet de la plateforme résonance magnétique nucléaire et biophysique, veuillez communiquer avec :

Michael Osborne
T + 514 343.6111 poste 1.0534
michael.osborne@umontreal.ca

Katherine L. B. Borden, Ph.D.

T + 514 343.6291
katherine.borden@umontreal.ca

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